Если вы добавили файл в индекс с помощью git add, но считаете, что этот файл не должен попасть в коммит(commit), то его можно удалить из индексируемых файлов с помощью команды:

Выдавать полные права доступа пользователю не всегда разумно.
Разумнее и правильно было бы определить пользователю именно те права, которые ему необходимы.

Полная или выборочная(по условия) очистка таблицы базы данных MySql.